Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF354BQ96LW1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF354BQ96LW1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF354BQ96LW1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF354BQ96LW1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF354BQ96LW1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF354BQ96LW1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF354BQ96LW1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF354BQ96LW1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF354BQ96LW1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF354BQ96LW1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF354BQ96LW1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF354BQ96LW1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF354BQ96LW1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF354BQ96LW1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF354BQ96LW1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF354BQ96LW1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms