Protein–RNA interactions for Protein: Q96LI5

CNOT6L, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6LQ96LI5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT6LQ96LI5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNOT6LQ96LI5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT6LQ96LI5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT6LQ96LI5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT6LQ96LI5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT6LQ96LI5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT6LQ96LI5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT6LQ96LI5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT6LQ96LI5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT6LQ96LI5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT6LQ96LI5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT6LQ96LI5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT6LQ96LI5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT6LQ96LI5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT6LQ96LI5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT6LQ96LI5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT6LQ96LI5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT6LQ96LI5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT6LQ96LI5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT6LQ96LI5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT6LQ96LI5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT6LQ96LI5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT6LQ96LI5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.5 ms