Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP3Q96JB5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK5RAP3Q96JB5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms