Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIC2Q96JB3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIC2Q96JB3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms