Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BORCS6Q96GS4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141 ms