Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC97Q96F63 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms