Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGF29Q96ES7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGF29Q96ES7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms