Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHF21BQ96EK2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF21BQ96EK2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms