Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PGBD4Q96DM1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms