Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC39Q96DD0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC39Q96DD0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms