Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KLHL29Q96CT2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL29Q96CT2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms