Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC127Q96BQ5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC127Q96BQ5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC127Q96BQ5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms