Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH8

RAB7B, Ras-related protein Rab-7b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7BQ96AH8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB7BQ96AH8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB7BQ96AH8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms