Protein–RNA interactions for Protein: Q96A58

RERG, Ras-related and estrogen-regulated growth inhibitor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERGQ96A58 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RERGQ96A58 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RERGQ96A58 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RERGQ96A58 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RERGQ96A58 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RERGQ96A58 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RERGQ96A58 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RERGQ96A58 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RERGQ96A58 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RERGQ96A58 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RERGQ96A58 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RERGQ96A58 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RERGQ96A58 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RERGQ96A58 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RERGQ96A58 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RERGQ96A58 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RERGQ96A58 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RERGQ96A58 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RERGQ96A58 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RERGQ96A58 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RERGQ96A58 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RERGQ96A58 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RERGQ96A58 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RERGQ96A58 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RERGQ96A58 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RERGQ96A58 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RERGQ96A58 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RERGQ96A58 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RERGQ96A58 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RERGQ96A58 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RERGQ96A58 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RERGQ96A58 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RERGQ96A58 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RERGQ96A58 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RERGQ96A58 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RERGQ96A58 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RERGQ96A58 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RERGQ96A58 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RERGQ96A58 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RERGQ96A58 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RERGQ96A58 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RERGQ96A58 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RERGQ96A58 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RERGQ96A58 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RERGQ96A58 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RERGQ96A58 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RERGQ96A58 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RERGQ96A58 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RERGQ96A58 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RERGQ96A58 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RERGQ96A58 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RERGQ96A58 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RERGQ96A58 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RERGQ96A58 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RERGQ96A58 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RERGQ96A58 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RERGQ96A58 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RERGQ96A58 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RERGQ96A58 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RERGQ96A58 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RERGQ96A58 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RERGQ96A58 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RERGQ96A58 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RERGQ96A58 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RERGQ96A58 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RERGQ96A58 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RERGQ96A58 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RERGQ96A58 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RERGQ96A58 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RERGQ96A58 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RERGQ96A58 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RERGQ96A58 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RERGQ96A58 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RERGQ96A58 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RERGQ96A58 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RERGQ96A58 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RERGQ96A58 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RERGQ96A58 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RERGQ96A58 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RERGQ96A58 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RERGQ96A58 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RERGQ96A58 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RERGQ96A58 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RERGQ96A58 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RERGQ96A58 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RERGQ96A58 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RERGQ96A58 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RERGQ96A58 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RERGQ96A58 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RERGQ96A58 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RERGQ96A58 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RERGQ96A58 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RERGQ96A58 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RERGQ96A58 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RERGQ96A58 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RERGQ96A58 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RERGQ96A58 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RERGQ96A58 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RERGQ96A58 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RERGQ96A58 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms