Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC47Q96A33 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC47Q96A33 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
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