Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms