Protein–RNA interactions for Protein: Q92621

NUP205, Nuclear pore complex protein Nup205, humanhuman

Predictions only

Length 2,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP205Q92621 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP205Q92621 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP205Q92621 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms