Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSC1Q92574 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms