Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA9

SREK1, Splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREK1Q8WXA9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREK1Q8WXA9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms