Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HELQQ8TDG4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms