Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC3

SHKBP1, SH3KBP1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHKBP1Q8TBC3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHKBP1Q8TBC3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHKBP1Q8TBC3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHKBP1Q8TBC3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHKBP1Q8TBC3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHKBP1Q8TBC3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHKBP1Q8TBC3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHKBP1Q8TBC3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHKBP1Q8TBC3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHKBP1Q8TBC3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHKBP1Q8TBC3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHKBP1Q8TBC3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHKBP1Q8TBC3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHKBP1Q8TBC3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHKBP1Q8TBC3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHKBP1Q8TBC3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHKBP1Q8TBC3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHKBP1Q8TBC3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHKBP1Q8TBC3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHKBP1Q8TBC3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHKBP1Q8TBC3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHKBP1Q8TBC3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHKBP1Q8TBC3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHKBP1Q8TBC3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHKBP1Q8TBC3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHKBP1Q8TBC3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHKBP1Q8TBC3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHKBP1Q8TBC3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHKBP1Q8TBC3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHKBP1Q8TBC3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHKBP1Q8TBC3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHKBP1Q8TBC3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms