Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL2Q8NHH9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms