Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMIEQ8NEW7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMIEQ8NEW7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
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