Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEA6

GLIS3, Zinc finger protein GLIS3, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3Q8NEA6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GLIS3Q8NEA6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GLIS3Q8NEA6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms