Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF169Q8NCN4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF169Q8NCN4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms