Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC29Q8NA56 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
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