Protein–RNA interactions for Protein: Q8N819

PPM1N, Probable protein phosphatase 1N, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1NQ8N819 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPM1NQ8N819 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPM1NQ8N819 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms