Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00612Q8N6U2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms