Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI8

CRLF3, Cytokine receptor-like factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLF3Q8IUI8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRLF3Q8IUI8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRLF3Q8IUI8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRLF3Q8IUI8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRLF3Q8IUI8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRLF3Q8IUI8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRLF3Q8IUI8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms