Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLNKQ7Z7G1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms