Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC3Q7Z5M5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms