Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX8Q6ZV50 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFX8Q6ZV50 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX8Q6ZV50 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX8Q6ZV50 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX8Q6ZV50 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX8Q6ZV50 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX8Q6ZV50 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX8Q6ZV50 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX8Q6ZV50 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX8Q6ZV50 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX8Q6ZV50 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX8Q6ZV50 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX8Q6ZV50 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX8Q6ZV50 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX8Q6ZV50 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX8Q6ZV50 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX8Q6ZV50 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX8Q6ZV50 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX8Q6ZV50 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX8Q6ZV50 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX8Q6ZV50 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms