Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
UBR3Q6ZT12 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
UBR3Q6ZT12 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms