Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRCAPQ6ZRS2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms