Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SAMD1Q6SPF0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms