Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP4Q6PIL6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms