Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY4

ZCCHC8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC8Q6NZY4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC8Q6NZY4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC8Q6NZY4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.9 ms