Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATL3Q6DD88 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATL3Q6DD88 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL3Q6DD88 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms