Protein–RNA interactions for Protein: Q6A163

KRT39, Keratin, type I cytoskeletal 39, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT39Q6A163 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT39Q6A163 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT39Q6A163 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms