Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4DIPQ5VU43 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE4DIPQ5VU43 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms