Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCO4Q5TGY1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms