Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDGFL1Q5TGJ6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDGFL1Q5TGJ6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDGFL1Q5TGJ6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms