Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRAPPC3LQ5T215 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC3LQ5T215 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms