Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
FRMPD1Q5SYB0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
FRMPD1Q5SYB0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC34■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms