Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LDLRAP1Q5SW96 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAP1Q5SW96 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 441.5 ms