Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PERM1Q5SV97 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms