Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP78Q5JTW2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CEP78Q5JTW2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.8 ms