Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGO2Q562F6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGO2Q562F6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms