Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1BQ53T94 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1BQ53T94 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1BQ53T94 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1BQ53T94 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1BQ53T94 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1BQ53T94 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF1BQ53T94 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF1BQ53T94 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF1BQ53T94 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF1BQ53T94 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF1BQ53T94 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1BQ53T94 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1BQ53T94 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms