Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP55Q53EZ4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CEP55Q53EZ4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP55Q53EZ4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms